Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDGFL1Q5TGJ6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms