Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
FRMPD1Q5SYB0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD1Q5SYB0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms