Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms