Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms