Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNT1Q5JUK3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms