Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB6CQ53S08 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6CQ53S08 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms