Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKDCCQ504Y2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms