Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC142Q17RM4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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