Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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