Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IMPG1Q17R60 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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