Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM187BQ17R55 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms