Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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