Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP6Q16828 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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