Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPP1R3AQ16821 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP1R3AQ16821 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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