Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ME3Q16798 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ME3Q16798 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ME3Q16798 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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