Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAMK4Q16566 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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