Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CRY1Q16526 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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