Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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