Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms