Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNCBQ16143 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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