Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS72Q15906 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS72Q15906 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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