Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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