Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RSU1Q15404 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RSU1Q15404 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RSU1Q15404 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSU1Q15404 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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