Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB35Q15286 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms