Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAT1Q14517 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FAT1Q14517 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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FAT1Q14517 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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