Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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