Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMB3Q13751 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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