Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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