Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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