Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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SKP2Q13309 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKP2Q13309 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms