Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR1H3Q13133 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NR1H3Q13133 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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