Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RLFQ13129 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RLFQ13129 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RLFQ13129 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLFQ13129 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLFQ13129 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms