Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DUSP4Q13115 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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