Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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