Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms