Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms