Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms