Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C2orf54Q08AI8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms