Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP4F3Q08477 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms