Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms