Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms