Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms