Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTBQ06643 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTBQ06643 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms