Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG1Q06432 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms