Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEUP1Q05D60 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEUP1Q05D60 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms