Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIN1Q05586 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms