Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE3AQ05086 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms