Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRG1Q02297 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms