Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPEQ02224 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms