Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLCB3Q01970 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms